Kas yra į ląsteles prasiskverbiantys peptidai?

Į ląsteles prasiskverbiantys peptidai yra maži peptidai, kurie gali lengvai prasiskverbti pro ląstelės membraną.Ši molekulių klasė, ypač CPP su tikslinėmis funkcijomis, žada efektyvų vaistų tiekimą į tikslines ląsteles.

Todėl jo tyrimai turi tam tikrą biomedicininę reikšmę.Šiame tyrime buvo tiriami skirtingą transmembraninį aktyvumą turintys CPP sekos lygmeniu, bandant išsiaiškinti veiksnius, turinčius įtakos CPP transmembraniniam aktyvumui, sekų skirtumus tarp skirtingo aktyvumo CPP ir NeCPP bei supažindinti su biologinių sekų analizės metodu.

CPP ir NonCPP sekos buvo gautos iš CPPsite duomenų bazės ir skirtingos literatūros, o transmembraniniai peptidai (HCPP, MCPP, LCPP), turintys didelį, vidutinį ir mažą transmembraninį aktyvumą, buvo išgauti iš CPP sekų, kad būtų galima sukurti duomenų rinkinius.Remiantis šiais duomenų rinkiniais, buvo atlikti šie tyrimai:

1, Skirtingų aktyvių CPP ir NonCPP aminorūgščių ir antrinės struktūros sudėtis buvo ištirta ANOVA.Nustatyta, kad elektrostatinė ir hidrofobinė aminorūgščių sąveika suvaidino svarbų vaidmenį transmembraniniame CPP aktyvumoje, o spiralinė struktūra ir atsitiktinis susisukimas taip pat paveikė CPP transmembraninį aktyvumą.

2. Skirtingo aktyvumo CPP fizinės ir cheminės savybės bei ilgiai buvo parodyti dvimatėje plokštumoje.Nustatyta, kad skirtingos veiklos CPP ir NeCPP gali būti sugrupuoti pagal tam tikras specialias savybes, o HCPP, MCPP, LCPP ir NonCPP buvo suskirstyti į tris grupes, parodant jų skirtumus;

3. Šiame darbe pristatoma biologinės sekos fizikinio ir cheminio centroido samprata, o seką sudarančios liekanos laikomos dalelių taškais, o seka abstrahuojama kaip dalelių sistema tyrimams.Šis metodas buvo pritaikytas analizuojant CPP, projektuojant skirtingos veiklos CPP į 3D plokštumą PCA metodu ir buvo nustatyta, kad dauguma CPP telkiasi kartu, o kai kurie LCPP klasterizuojasi kartu su NeCPP.

Šis tyrimas turi įtakos CPP projektavimui ir skirtingų veiklų CPP sekos skirtumų supratimui.Be to, šiame darbe pristatytas biologinių sekų fizikinio ir cheminio centroido analizės metodas gali būti naudojamas ir kitų biologinių problemų analizei.Tuo pačiu metu jie gali būti naudojami kaip įvesties parametrai kai kurioms biologinės klasifikacijos problemoms spręsti ir vaidina vaidmenį atpažįstant šabloną.