Šiame darbe pristatomos dvi pagrindinės aminorūgštys – glicinas (Gly) ir alaninas (Ala).Taip yra daugiausia todėl, kad jie gali veikti kaip bazinės aminorūgštys, o pridėjus grupes prie jų gali susidaryti kitų rūšių aminorūgštys.
Glicinas turi ypatingą saldų skonį, todėl jo angliškas pavadinimas kilęs iš graikiško žodžio glykys (saldus).Glicino vertimas į kinų kalbą ne tik reiškia „saldus“, bet ir turi panašų tarimą, kurį galima pavadinti „ištikimybės, pasiekimų ir elegancijos“ modeliu.Dėl saldaus skonio glicinas maisto pramonėje dažnai naudojamas kaip kvapioji medžiaga kartumui pašalinti ir saldumui padidinti.Glicino šoninė grandinė yra maža, turinti tik vieną vandenilio atomą.Dėl to jis skiriasi.Tai bazinė aminorūgštis be chiralumo.
Baltymuose esantis glicinas pasižymi mažu dydžiu ir lankstumu.Pavyzdžiui, kolageno trijų grandžių spiralės konformacija yra labai ypatinga.Kiekvienam dviem likučiams turi būti vienas glicinas, kitaip tai sukels per daug sterinių kliūčių.Panašiai, norint sujungti du baltymo domenus, dažnai reikia glicino, kad būtų užtikrintas konformacinis lankstumas.Tačiau jei glicinas yra pakankamai lankstus, jo stabilumas būtinai yra nepakankamas.
Glicinas yra vienas iš spoilerių formuojant α-spiralę.Priežastis ta, kad šoninės grandinės yra per mažos, kad iš viso stabilizuotų konformaciją.Be to, glicinas dažnai naudojamas buferiniams tirpalams ruošti.Tie, kurie atlieka elektroforezę, dažnai tai prisimena.
Angliškas alanino pavadinimas kilęs iš vokiško žodžio acetaldehidas, o kiniškas pavadinimas yra lengviau suprantamas, nes alanine yra trys anglies atomai, o cheminis jo pavadinimas yra alaninas.Tai paprastas pavadinimas, kaip ir aminorūgšties pobūdis.Alanino šoninė grandinė turi tik vieną metilo grupę ir yra šiek tiek didesnė nei glicino.Kai nubraižiau kitų 18 aminorūgščių struktūrines formules, prie alanino pridėjau grupes.Baltymuose alaninas yra tarsi plyta, įprasta pagrindinė statybinė medžiaga, kuri niekam neprieštarauja.
Šoninė alanino grandinė turi mažai kliūčių ir yra α-spirale, kuri yra konformacija.Jis taip pat yra labai stabilus, kai yra β sulankstytas.Baltymų inžinerijoje, jei norite mutuoti aminorūgštį be konkretaus baltymo taikinio, paprastai galite ją mutuoti į alaniną, o tai nėra lengva sunaikinti bendrą baltymo konformaciją.
Paskelbimo laikas: 2023-05-29