Šie antimikrobiniai peptidai iš pradžių buvo gauti iš vabzdžių, žinduolių, varliagyvių ir kt. gynybinių sistemų ir daugiausia apima keturias kategorijas:
1. Cecropin iš pradžių buvo Cecropiamoth imuninėje limfoje, kuri daugiausia randama kituose vabzdžiuose, o panašių baktericidinių peptidų taip pat yra kiaulių žarnyne.Jiems paprastai būdinga stipriai šarminė N-galinė sritis, po kurios seka ilgas hidrofobinis fragmentas.
2. Xenopus antimikrobiniai peptidai (magaininas) gaunami iš varlių raumenų ir skrandžio.Taip pat nustatyta, kad Xenopus antimikrobinių peptidų struktūra yra spiralinė, ypač hidrofobinėje aplinkoje.Ksenopuso antipeptidų konfigūracija lipidų sluoksniuose buvo tiriama naudojant N žymėtą kietosios fazės BMR.Remiantis cheminiu acilamino rezonanso poslinkiu, ksenopuso antipeptidų spiralės buvo lygiagrečiai dvisluoksniai paviršiai ir galėjo susijungti, sudarydami 13 mm narvelį, kurio periodinė spiralinė struktūra buvo 30 mm.
3. Defensin Defence peptidai yra gaunami iš žmogaus polikariotinių neutrofilų triušio polimakrofagų, turinčių pilną branduolio skiltelę ir gyvūnų žarnyno ląsteles.Grupė antimikrobinių peptidų, panašių į žinduolių gynybinius peptidus, buvo išgauta iš vabzdžių, vadinamų "vabzdžių gynybos peptidais".Skirtingai nuo žinduolių gynybos peptidų, vabzdžių gynybiniai peptidai yra aktyvūs tik prieš gramteigiamas bakterijas.Netgi vabzdžių apsaugos peptiduose yra šešios Cys liekanos, tačiau disulfidinio sujungimo vienas su kitu metodas skiriasi.Antibakterinių peptidų, ekstrahuotų iš Drosophila melanogast, intramolekulinis disulfido tilto surišimo būdas buvo panašus į augalų apsaugos peptidų.Kristalinėmis sąlygomis gynybiniai peptidai pateikiami kaip dimerai.
4.Tachiplezinas gaunamas iš pasaginių krabų, vadinamų pasagais.Konfigūracijos tyrimai rodo, kad jis turi antilygiagrečią B sulankstymo konfigūraciją (3–8 padėtys, 11–16 padėčių), kuriojeβ-kampas yra sujungtas vienas su kitu (8-11 padėčių), o tarp 7 ir 12 padėčių ir tarp 3 ir 16 padėčių susidaro dvi disulfidinės jungtys.Šioje struktūroje hidrofobinė aminorūgštis yra vienoje plokštumos pusėje, o šešios katijoninės liekanos atsiranda molekulės uodegoje, todėl struktūra taip pat yra biofilinė.
Iš to išplaukia, kad beveik visi antimikrobiniai peptidai yra katijoninio pobūdžio, nors skiriasi ilgiu ir aukščiu;Aukščiausioje dalyje, nesvarbu, ar tai yra alfa-spiralinė, arbaβ- sulankstoma, bitropinė struktūra yra bendras bruožas.
Paskelbimo laikas: 2023-04-20